Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Grik5Q61626 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grik5Q61626 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Grik5Q61626 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Grik5Q61626 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Grik5Q61626 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Grik5Q61626 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Grik5Q61626 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Grik5Q61626 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grik5Q61626 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grik5Q61626 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grik5Q61626 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms