Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim25Q61510 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim25Q61510 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim25Q61510 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim25Q61510 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim25Q61510 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim25Q61510 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim25Q61510 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim25Q61510 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim25Q61510 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim25Q61510 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim25Q61510 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms