Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sox17Q61473 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sox17Q61473 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sox17Q61473 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sox17Q61473 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sox17Q61473 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sox17Q61473 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sox17Q61473 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms