Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd3Q61060 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxd3Q61060 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxd3Q61060 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd3Q61060 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Foxd3Q61060 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Foxd3Q61060 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Foxd3Q61060 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Foxd3Q61060 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.1 ms