Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc1Q61056 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc1Q61056 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc1Q61056 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trpc1Q61056 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trpc1Q61056 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trpc1Q61056 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc1Q61056 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms