Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Neurod1Q60867 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Neurod1Q60867 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Neurod1Q60867 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Neurod1Q60867 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Neurod1Q60867 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Neurod1Q60867 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Neurod1Q60867 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Neurod1Q60867 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Neurod1Q60867 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Neurod1Q60867 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Neurod1Q60867 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Neurod1Q60867 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms