Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SkiQ60698 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SkiQ60698 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SkiQ60698 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SkiQ60698 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SkiQ60698 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SkiQ60698 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SkiQ60698 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SkiQ60698 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SkiQ60698 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SkiQ60698 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SkiQ60698 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SkiQ60698 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms