Protein–RNA interactions for Protein: Q60648

Gm2a, Ganglioside GM2 activator, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2aQ60648 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm2aQ60648 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm2aQ60648 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm2aQ60648 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm2aQ60648 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm2aQ60648 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm2aQ60648 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms