Protein–RNA interactions for Protein: Q60595

Xlr3a, X-linked lymphocyte-regulated protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr3aQ60595 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Xlr3aQ60595 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Xlr3aQ60595 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Xlr3aQ60595 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Xlr3aQ60595 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Xlr3aQ60595 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Xlr3aQ60595 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms