Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJV6

Lmtk3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, mousemouse

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk3Q5XJV6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lmtk3Q5XJV6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Lmtk3Q5XJV6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lmtk3Q5XJV6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Lmtk3Q5XJV6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lmtk3Q5XJV6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lmtk3Q5XJV6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lmtk3Q5XJV6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lmtk3Q5XJV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
Lmtk3Q5XJV6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Lmtk3Q5XJV6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Lmtk3Q5XJV6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Lmtk3Q5XJV6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Lmtk3Q5XJV6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Lmtk3Q5XJV6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Lmtk3Q5XJV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Lmtk3Q5XJV6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Lmtk3Q5XJV6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Lmtk3Q5XJV6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Lmtk3Q5XJV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Lmtk3Q5XJV6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Lmtk3Q5XJV6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Lmtk3Q5XJV6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Lmtk3Q5XJV6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Lmtk3Q5XJV6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.9 ms