Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pabpn1lQ5XFR0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpn1lQ5XFR0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpn1lQ5XFR0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpn1lQ5XFR0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pabpn1lQ5XFR0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pabpn1lQ5XFR0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pabpn1lQ5XFR0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms