Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNF219Q5W0B1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF219Q5W0B1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RNF219Q5W0B1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RNF219Q5W0B1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
RNF219Q5W0B1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RNF219Q5W0B1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms