Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HACD4Q5VWC8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HACD4Q5VWC8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HACD4Q5VWC8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HACD4Q5VWC8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD4Q5VWC8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD4Q5VWC8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms