Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ANKRD20A3Q5VUR7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ANKRD20A3Q5VUR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ANKRD20A3Q5VUR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ANKRD20A3Q5VUR7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD20A3Q5VUR7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms