Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf135Q5VTT2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
C9orf135Q5VTT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C9orf135Q5VTT2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf135Q5VTT2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf135Q5VTT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms