Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTQ0

TTC39B, Tetratricopeptide repeat protein 39B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39BQ5VTQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC39BQ5VTQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC39BQ5VTQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC39BQ5VTQ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC39BQ5VTQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC39BQ5VTQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TTC39BQ5VTQ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC39BQ5VTQ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms