Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tdrd5Q5VCS6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tdrd5Q5VCS6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd5Q5VCS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd5Q5VCS6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd5Q5VCS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd5Q5VCS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.8 ms