Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIF1Q5UIP0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RIF1Q5UIP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RIF1Q5UIP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RIF1Q5UIP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIF1Q5UIP0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RIF1Q5UIP0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RIF1Q5UIP0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RIF1Q5UIP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms