Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF5Q5TYX0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRAMEF5Q5TYX0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRAMEF5Q5TYX0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRAMEF5Q5TYX0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF5Q5TYX0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF5Q5TYX0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms