Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATAD3BQ5T9A4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATAD3BQ5T9A4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD3BQ5T9A4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATAD3BQ5T9A4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATAD3BQ5T9A4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATAD3BQ5T9A4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms