Protein–RNA interactions for Protein: Q5T160

RARS2, Probable arginine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARS2Q5T160 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARS2Q5T160 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARS2Q5T160 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARS2Q5T160 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARS2Q5T160 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RARS2Q5T160 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARS2Q5T160 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARS2Q5T160 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259 ms