Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmo1Q5SXG7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vmo1Q5SXG7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmo1Q5SXG7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmo1Q5SXG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmo1Q5SXG7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms