Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LDLRAP1Q5SW96 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LDLRAP1Q5SW96 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LDLRAP1Q5SW96 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LDLRAP1Q5SW96 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LDLRAP1Q5SW96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
LDLRAP1Q5SW96 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LDLRAP1Q5SW96 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms