Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUR0

Pfas, Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PfasQ5SUR0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PfasQ5SUR0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PfasQ5SUR0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PfasQ5SUR0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PfasQ5SUR0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PfasQ5SUR0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PfasQ5SUR0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PfasQ5SUR0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PfasQ5SUR0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PfasQ5SUR0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PfasQ5SUR0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PfasQ5SUR0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PfasQ5SUR0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PfasQ5SUR0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PfasQ5SUR0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PfasQ5SUR0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PfasQ5SUR0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PfasQ5SUR0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PfasQ5SUR0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms