Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Phf12Q5SPL2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Phf12Q5SPL2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf12Q5SPL2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf12Q5SPL2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf12Q5SPL2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf12Q5SPL2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf12Q5SPL2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms