Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAPPA-AS1Q5QFB9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms