Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ68

SPDYC, Speedy protein C, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYCQ5MJ68 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPDYCQ5MJ68 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPDYCQ5MJ68 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPDYCQ5MJ68 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPDYCQ5MJ68 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SPDYCQ5MJ68 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SPDYCQ5MJ68 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SPDYCQ5MJ68 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms