Protein–RNA interactions for Protein: Q5JXA9

SIRPB2, Signal-regulatory protein beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRPB2Q5JXA9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SIRPB2Q5JXA9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIRPB2Q5JXA9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIRPB2Q5JXA9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIRPB2Q5JXA9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SIRPB2Q5JXA9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRPB2Q5JXA9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRPB2Q5JXA9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRPB2Q5JXA9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SIRPB2Q5JXA9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRPB2Q5JXA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIRPB2Q5JXA9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 410.8 ms