Protein–RNA interactions for Protein: Q5JR12

PPM1J, Protein phosphatase 1J, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1JQ5JR12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPM1JQ5JR12 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PPM1JQ5JR12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPM1JQ5JR12 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPM1JQ5JR12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPM1JQ5JR12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPM1JQ5JR12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms