Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNFAIP8L3Q5GJ75 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TNFAIP8L3Q5GJ75 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP8L3Q5GJ75 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TNFAIP8L3Q5GJ75 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TNFAIP8L3Q5GJ75 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TNFAIP8L3Q5GJ75 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms