Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRT3Q5FWE3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRT3Q5FWE3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRT3Q5FWE3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRRT3Q5FWE3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRRT3Q5FWE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms