Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam208bQ5DTT3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam208bQ5DTT3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam208bQ5DTT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam208bQ5DTT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam208bQ5DTT3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam208bQ5DTT3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms