Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KHDC3LQ587J8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KHDC3LQ587J8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KHDC3LQ587J8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
KHDC3LQ587J8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KHDC3LQ587J8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KHDC3LQ587J8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 485.9 ms