Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
COBLL1Q53SF7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
COBLL1Q53SF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COBLL1Q53SF7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
COBLL1Q53SF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COBLL1Q53SF7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COBLL1Q53SF7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
COBLL1Q53SF7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COBLL1Q53SF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COBLL1Q53SF7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COBLL1Q53SF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COBLL1Q53SF7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COBLL1Q53SF7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COBLL1Q53SF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COBLL1Q53SF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COBLL1Q53SF7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms