Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB6CQ53S08 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAB6CQ53S08 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RAB6CQ53S08 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RAB6CQ53S08 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAB6CQ53S08 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAB6CQ53S08 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms