Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIPR1Q53HC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EIPR1Q53HC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIPR1Q53HC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIPR1Q53HC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIPR1Q53HC9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms