Protein–RNA interactions for Protein: Q53EL6

PDCD4, Programmed cell death protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4Q53EL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDCD4Q53EL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDCD4Q53EL6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDCD4Q53EL6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDCD4Q53EL6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDCD4Q53EL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCD4Q53EL6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms