Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ARHGAP29Q52LW3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARHGAP29Q52LW3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARHGAP29Q52LW3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ARHGAP29Q52LW3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARHGAP29Q52LW3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARHGAP29Q52LW3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms