Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM259Q4ZIN3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMEM259Q4ZIN3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMEM259Q4ZIN3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMEM259Q4ZIN3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms