Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Arap1Q4LDD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Arap1Q4LDD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Arap1Q4LDD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Arap1Q4LDD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Arap1Q4LDD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Arap1Q4LDD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Arap1Q4LDD4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Arap1Q4LDD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Arap1Q4LDD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Arap1Q4LDD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Arap1Q4LDD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Arap1Q4LDD4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Arap1Q4LDD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Arap1Q4LDD4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Arap1Q4LDD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Arap1Q4LDD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Arap1Q4LDD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Arap1Q4LDD4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms