Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO43Q4G163 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO43Q4G163 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO43Q4G163 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO43Q4G163 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FBXO43Q4G163 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FBXO43Q4G163 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms