Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZBED5Q49AG3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZBED5Q49AG3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZBED5Q49AG3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED5Q49AG3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED5Q49AG3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED5Q49AG3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms