Protein–RNA interactions for Protein: Q3V4B5

Commd6, COMM domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd6Q3V4B5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Commd6Q3V4B5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Commd6Q3V4B5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Commd6Q3V4B5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Commd6Q3V4B5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Commd6Q3V4B5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Commd6Q3V4B5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms