Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Carmil2Q3V3V9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil2Q3V3V9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Carmil2Q3V3V9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Carmil2Q3V3V9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil2Q3V3V9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Carmil2Q3V3V9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Carmil2Q3V3V9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms