Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930596D02RikQ3V0H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4930596D02RikQ3V0H9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930596D02RikQ3V0H9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms