Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hipk4Q3V016 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hipk4Q3V016 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hipk4Q3V016 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hipk4Q3V016 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hipk4Q3V016 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hipk4Q3V016 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hipk4Q3V016 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms