Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm6Q3UZD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Prdm6Q3UZD5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prdm6Q3UZD5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Prdm6Q3UZD5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prdm6Q3UZD5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prdm6Q3UZD5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prdm6Q3UZD5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prdm6Q3UZD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms