Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pfdn4Q3UWL8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pfdn4Q3UWL8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pfdn4Q3UWL8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pfdn4Q3UWL8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pfdn4Q3UWL8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pfdn4Q3UWL8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms