Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arhgef9Q3UTH8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Arhgef9Q3UTH8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arhgef9Q3UTH8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arhgef9Q3UTH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arhgef9Q3UTH8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arhgef9Q3UTH8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms