Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lsg1Q3UM18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lsg1Q3UM18 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Lsg1Q3UM18 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lsg1Q3UM18 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lsg1Q3UM18 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lsg1Q3UM18 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lsg1Q3UM18 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsg1Q3UM18 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsg1Q3UM18 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lsg1Q3UM18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms